Nhà phát triển chính của Assassin Creed Shadows đảm bảo cho người chơi rằng việc chọn một nhân vật chính sẽ không ảnh hưởng đáng kể đến trải nghiệm của họ. Trò chơi có hai nhân vật có thể chơi được: Naoe, một nữ Shinobi và Yasuke, một Samurai châu Phi lịch sử, một sự lựa chọn đã tạo ra cuộc thảo luận trước khi phát hành.
Những lo ngại nảy sinh rằng việc tập trung vào một nhân vật có thể dẫn đến việc bỏ lỡ các điểm cốt truyện quan trọng hoặc trò chơi. Giám đốc sáng tạo Jonathan Dumont đã giải quyết những mối quan tâm này, mô tả cách tiếp cận cân bằng của riêng mình: ông xen kẽ giữa các nhân vật, dành khoảng 3-5 giờ cho một trước khi chuyển sang người kia trong 2-3 giờ.
Tuy nhiên, Dumont nhấn mạnh rằng việc ưu tiên một nhân vật sẽ không cản trở trải nghiệm tổng thể. Trong khi mỗi nhân vật chính tự hào có các chuỗi mở đầu và cốt truyện cá nhân duy nhất, trò chơi đều thích nghi với sự lựa chọn của người chơi. Anh ấy khuyến khích người chơi chơi như một nhân vật ưa thích của họ:
"Tôi không tin rằng bạn sẽ bỏ lỡ nhiều. Nó thực sự phụ thuộc vào phong cách chơi của bạn. Bạn có thể thử nghiệm và xem trò chơi điều chỉnh dựa trên lựa chọn nhân vật của bạn. Mỗi anh hùng có những lời giới thiệu riêng biệt và các nhiệm vụ chuyên dụng, nhưng trò chơi cốt lõi Vẫn linh hoạt và thích nghi với anh hùng đã chọn của bạn. "